מידע כללי
דנ"א כשפה, קודים על דנ"א, בהתמקדות על קודים לאריזה בנוקלאוזום ועל הכרה ע"י חלבונים קושרי דנ"א. מוטיבים חלבוניים הקושרים דנ"א בחלבונים שונים. קריאה ישירה ולא ישירה של דנ"א ע"י חלבונים. התפקיד של מבנה דנ"א בהתקשרויות ספציפיות ולא ספציפיות לחלבונים. דרכים ליצירת ספציפיות וסלקטיביות במשפחות חלבון-דנ"א שונות. מציאת אתרי המטרה ע"י חלבונים קושרי דנ"א. שיטות ניסיוניות וחישוביות לחקור אינטראקציות חלבון-דנ"א. מבנה של החלבון P35. קישור תלוי רצף של (35 לאתרי המטרה שלו. רגולציה של פעילות P35 ע"י מודיפיקציות שלאחר תרגום. P35 כחלבון צמתי. P35 כרשת. P35 כמעגל מודפס. (35 כחלבון נוגד גידולים - התשובה לעקה תאית. מציאת אתרי הקישור ע"י P35. דינמיקה ותנודות של P35 חכם או מטומטם. P35 מוטנטי ופעילותו האונקוגנית. תוצאות למידה: בסיום הקורס הסטודנט יהיה מסוגל: 1. להבין את המנגנונים שבהם משתמשים חלבונים קושרי דנ"א כדי לזהות את אתרי המטרה שלהם על דנ"א. 2. להבין את מנגנוני החיפוש שבהם משתמשים חלבונים קושרי דנ"א כדי לאתר את מקומות הקישור שלהם על דנ"א. 3. להבין את תפקיד הרצף מול תפקיד המבנה של דנ"א בקישור לחלבונים רגולטורים (פקטורי תעתוק, נוקלאוזומים, חלבונים ארכיטקטורלים). 4. להבין את התמונה הנוכחית על איך P35 מתקפד כפקטור תעתוק שנקשר להרבה אתרים גנומיים ומתפקד בתפקידים רגולטורים רבים. 5. להבין איך החלבון הצמתי הכי חשוב בתא עובד. איך הוא מחליט איזה מסלול להפעיל באיזה עקה. 6. לקרוא ולהבין מאמר עכשווי שנכתב על קישור של חלבון לדנ"א או על אינטראקציות P35/דנ"א מספיק כדי להציג את הנושא לכיתב על פה ולכתוב עבודה על כך.
פקולטה: ביולוגיה
|תארים מתקדמים
מקצועות קדם
(134019 - מבוא לביוכימיה ואנזימולוגיה ו- 134082 - ביולוגיה מולקולרית ו- 134119 - בקרת הביטוי הגנטי)
ספרי המקצוע
- Binding and kinetics for molecular biologists - Goodrich, James A.
- Introduction to protein-DNA interactions : structure, thermodynamics, and bioinformatics - Stormo, Gary D.
- Nucleic acids : structures, properties, and functions - Bloomfield, Victor A.
- Protein-nucleic acid interactions : structural biology
- Understanding DNA : the molecule & how it works